探针法荧光定量PCR试剂盒制备工艺流程主要包括核酸提取、反转录、探针设计合成、反应体系配制以及荧光定量PCR检测等步骤。具体流程如下:
1.核酸提取
样本准备:采集目标样本,如组织、血液或细胞。
RNA 提取:使用QIAGEN RNeasy Mini Kit或其他类似试剂盒,按照说明书进行RNA提取,确保RNA的纯度和完整性。
DNA 提取:若需从样本中提取DNA,采用相应的基因组DNA纯化试剂盒进行操作。
2.反转录
cDNA 合成:将提取的RNA反转录成cDNA,通常使用PrimeScript RT reagent Kit with gDNA Eraser,此试剂盒包含去除基因组DNA的gDNA Eraser和反转录酶。
DNase I处理:在反转录前对Total RNA样品进行DNase I处理,以除去残存的基因组DNA,避免对后续实验造成干扰。
3.探针设计合成
探针设计:根据目标基因序列设计特异性探针,一般选择与目标序列匹配的寡核苷酸探针,并在5’端标记荧光报告基团,3’端标记淬灭基团。
探针合成:利用自动化核酸合成仪器进行探针的化学合成,并纯化得到的探针以确保其质量。
混合试剂:将PCR酶、dNTPs、缓冲液、Mg??、引物、探针和模板cDNA按比例混合,形成完整的PCR反应体系。
分装反应液:将混合好的反应液分装到PCR管或多孔板中,每个反应单元体积一致,确保实验结果的准确性和重复性。
5.荧光定量PCR检测
PCR 扩增:在实时荧光定量PCR仪器中进行扩增,通过设定特定的循环参数(变性、退火、延伸)来控制PCR过程。
荧光数据采集:仪器在每个循环后自动采集荧光数据,实时监测荧光信号的变化,并根据Ct值计算初始模板量。
数据分析输出:软件自动生成扩增曲线和熔解曲线,并进行数据分析,输出检测结果。